剧集以疫情大流行后的日本为舞台，讲述了拥有政府否定人权的特殊力量的“Valiant”的存在，描述了拥有不同背景的年轻男女的相遇，在不合理的世界中追求自由的战斗，以及在那里孕育出的爱情。

蕾是个非常喜欢花草植物的中学二年级生，绘里香是个喜欢服装设计的中学二年级生，某日她们梦见了在一个充满美丽花草的地方，还有妖精四处飞舞·····　　而就在几天后转学到明堂学园的蕾，真的遇上了在梦里见到的妖精，妖精也向蕾表示，希望她能够为守护“心之大树”、并让大家的“心之花”绽放而战······一次偶然的机会，绘里香也加入了进来，和蕾成为了光之美少女……

本作的故事源于一个都市传说，据闻如果能够收集齐被称为“PlatonicHeart”的宝石就能实现任何愿望，但只有被选中之人有资格参加宝石的争夺战，而当中也充满着各种谜团，本作一共有11名主要女性角色，主人公清纯女学院2年级生的伊势岛绫就是其中一人，她们的任务就是要夺回宝石，故事基本在这样的模式下展开。

为了守护“希望之园”和其力量来源“钻石链”，光之美少女、夏妮露米纳斯与希望之园的七位战士共同对抗邪恶的魔女。

新学期开始，美墨渚和雪城穗乃香成为菲诺奈学院女子中学部三年级学生，过着普通女孩的校园生活。　　而梅普鲁、米普鲁和保伦在上次战斗后陷入了漫长的沉睡。　　此时，在光之园，在激战后受了伤的女王分裂成数个部分，消失在远处。与此同时，渚和穗乃香遭到了萨凯那的袭击。　　突然，梅普鲁和米普鲁苏醒过来，两人使用新的变身器再一次变身成为“光之美少女”，不仅衣服改变了，而且力量居然也提升了！？　　为了让失去了记忆和原本姿态的女王恢复原样，渚和穗乃香以及苏醒后力量得到提升的梅普鲁、米普鲁和保伦，将与不可思议的少女・九条光一起展开新的故事。　　光之美少女们能够让女王恢复原来的样子吗？

花咲蕾是一个热爱花卉、非常了解花卉知识的初二学生。某天，随着父母搬家来到“希望花市”的途中，花咲蕾做了一个奇怪的梦，梦中的她站在一棵名为“心之大树”的树前，看着光之美少女与暗之美少女战斗并被打倒，而大树上的花朵瞬间全都枯萎了，此时有只妖精从树中窜出，蕾也从梦中惊醒了。不料某天放学后，梦中出现的妖精竟然出现在她的眼前，并希望花小蕾可以成为传说中的战士“光之美少女”，来帮忙打倒敌人，让人类之心的源头“心之大树”可以再恢复到之前繁花盛开的模样，并让大家的“心之花”绽放而战。但蕾犹豫了。就在此时，不明的敌人出现了，并将魔爪伸向了同班好友来海绘里香。为了拯救好友，花咲蕾决定要成为光之美少女。之后，好友来海绘里香、学生会长明堂院树以及曾将的光之美少女月影百合纷纷加入进来，和蕾一起成为了光之美少女，为拯救“心之大树”，粉碎沙漠使徒征服世界的野心而战斗